中国铁路经济规划研究院有限公司由原中国铁路经济规划研究院依据《公司法》改制成立的公司制企业，是国铁集团出资的一人有限责任公司，2018年3月19日完成工商注册登记，注册资本金16325万元。
改制后的公司职责定位是：国铁集团工程设计咨询审查机构、铁路发展改革主要研究部门、工程建设标准归口管理单位。
2013年4月, 铁道部经济规划研究院（铁道部工程设计鉴定中心）事业法人整体转为企业法人。
2015年2月, 中国铁路经济规划研究院工商注册登记成立。
2015年5月，中国铁路总公司批复，受总公司委托，经规院负责铁路建设工作时，使用中国铁路总公司工程设计鉴定中心名称。
2002年 1月，铁道部工程设计鉴定中心、铁道部经济规划研究院、铁路工程技术标准所，合并组建全新的铁道部经济规划研究院。
2003年 10月，铁路工程定额所由铁道部经济规划研究院代管。
2004年
8月，铁路工程定额所正式并入铁道部经济规划研究院。
2008年
8月，设立内设机构铁路客站管理部。
2010年
1月，铁道部设立铁路客站建设总指挥部，挂靠经规院。
1978年6月，成立铁道部规划院。
1980年3月，铁道部设计预算鉴定委员会更名为铁道部设计鉴定委员会。
1983年1月，成立铁道部专业设计院规范处。
1984年6月，成立铁道部基建总局概算预算定额管理所。
1989年7月，铁道部设计鉴定委员会并入铁道部建设司。
1989年9月，铁道部基建总局概算预算定额管理所更名为铁道部建设司工程定额所。
1990年1月，铁道部专业设计院规范处更名为铁道部建设司标准科情所。
1991年2月，铁道部规划院与铁道部科学研究院两个研究室合并，成立铁道部经济规划研究院。
1994年6月，铁道部成立工程设计鉴定中心。
1998年 1月，铁道部建设司标准科情所更名为铁路工程技术标准所。
1953年3月，成立铁道部技术鉴定委员会。
1955年12月，更名为铁道部设计预算鉴定委员会。
1958年9月，并入铁道部基本建设总局。
1960年5月，独立设置铁道部设计预算鉴定委员会。
1967年6月至1978年5月，撤销铁道部设计预算鉴定委员会，工作暂停。
中国铁路经济规划研究院有限公司于2013年4月1日系由铁道部经济规划研究院（铁道部工程设计鉴定中心）事业法人整体转为企业法人，2015年2月2日完成工商注册登记，2018年3月19日变更为“中国铁路经济规划研究院有限公司”。
铁道部经济规划研究院（铁道部工程设计鉴定中心）合并重组于2002年1月，是在原铁道部工程设计鉴定中心、原铁道部经济规划研究院、原铁路工程技术标准所和原铁路工程定额所（2004年8月并入）四个单位基础上组建而来。2008年，为加快铁路客站建设，设立内设机构铁路客站管理部；2010年，原铁道部设立铁路客站建设总指挥部，挂靠经规院，2012年，为适应铁路改革需要，该机构整体划入原铁道部工管中心。其中：
1. 原铁道部工程设计鉴定中心。
前身是1953年铁道部为统一设计技术标准增设的技术鉴定委员会，1955年12月更名为铁道部设计预算鉴定委员会，是铁道部机关的组成部分。经历十年文化大革命以后，1978年6月，铁道部重新成立设计预算鉴定委员会，主要负责审查新建铁路干线、复线、支线、枢纽、电气化铁路、独立特大桥、大型客站站房及基建投资在一千五百万元以上的旧线、枢纽技术改造的初步设计（包括概算）。1989年7月，铁道部建设司成立，设计鉴定委员会被撤销，其工作纳入建设司设计鉴定处。1994年6月，为适应铁路发展，进一步加强铁路工程设计鉴定工作，铁道部决定成立铁道部工程设计鉴定中心，作为部直属事业单位，受部委托承担部管铁路大中型建设项目的设计及概算的审查鉴定工作。2002年1月1日，并入重组后的铁道部经济规划研究院。
2. 原铁道部经济规划研究院。
前身是1974年成立的交通部规划院，1978年铁道部与交通部分立时成立了铁道部规划院，开展铁路规划专项研究工作。1991年2月，铁道部规划院与铁道部科学研究院运输与经济研究所的管理经济和经济体制改革两个研究室合并，成立了原铁道部经济规划研究院，基本职责是：为铁路发展战略、方针和目标提供科学依据；为制订铁路宏观经济管理的方针、政策与基本体制、制度提出建议；为编制铁路中长期规划与进行重大项目建设提出建议方案；在铁路软科学和对外交流方面发挥重要作用。2002年1月1日，并入重组后的铁道部经济规划研究院。
3. 原铁路工程技术标准所。
前身是1983年成立的铁道部专业设计院规范处，主要负责铁路工程建设标准，工务工程、电力照明、修车设备产品标准，标准设计，基建科研四方面管理工作，业务受原铁道部基建总局领导。1990年1月1日，铁道部专业设计院规范处更名为铁道部建设司标准科情所，行政工作由铁道部专业设计院代管，业务工作受铁道部建设司直接领导。除负责工程建设标准、三个专业产品标准、标准设计、基建科研四方面管理工作之外，还承担铁道部下属10余个基建情报网的管理工作。1998年1月1日，建设司标准科情所更名为铁路工程技术标准所，行政工作仍由铁道部专业设计院管理，业务工作受铁道部建设司指导，主要负责工程建设标准、三个专业产品标准、标准设计三方面管理工作。2002年1月1日，并入重组后的铁道部经济规划研究院。
4. 原铁路工程定额所。
其前身是1984年6月成立的铁道部基建总局概算预算定额管理所，由铁三院代管。1989年9月更名为铁道部建设司工程定额所，行政工作由铁三院代管，业务工作受铁道部建设司指导。1998年12月改名为铁路工程定额所，业务工作受建设司领导，机构设置和人员编制由所在单位确定。2003年10月改由铁道部经济规划研究院代管，业务工作由铁道部建设司指导。2004年8月并入重组后的铁道部经济规划研究院，2006年变更为独立事业单位法人机构。
